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蛋白质分子量测定_质谱分析_百泰派克生物

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高效富集磷酸肽的五种策略比较(IMAC/TiO₂等)

蛋白磷酸化作为最常见的翻译后修饰之一,在信号转导、细胞周期、凋亡等生物过程中发挥核心作用。由于磷酸肽在复杂蛋白组中通常丰度极低(<1%),直接进行LC-MS/MS分析难以实现全面覆盖。因此,在质谱分析前进行有效的磷酸肽富集成为揭示磷酸化修饰网络的关键步骤。 一、IMAC(Immobilize

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高通量免疫多肽组学分析平台助力药物靶点筛选

在现代药物研发过程中,靶点发现始终是核心挑战之一。尤其是在肿瘤、感染性疾病和自身免疫疾病等复杂病理环境中,精准识别并验证可成药靶点,是决定药物开发成败的关键因素。近年来,免疫多肽组学(Immunopeptidomics)作为质谱驱动的前沿技术,正在成为药物靶点筛选与验证的重要工具。 一、什么是免疫

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免疫肽组大数据分析:从HLA绑定预测到个性化免疫图谱

在精准医学时代,如何理解免疫系统“看到”什么,反应“怎么触发”,已成为免疫治疗和疫苗设计中的核心科学问题。免疫肽组学(immunopeptidomics),正是解码这一问题的关键工具。它通过质谱技术直接捕获并鉴定呈递于HLA分子上的肽段,从而勾勒出一幅

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构建高质量的免疫肽组数据库:质谱数据的标准化与整合

免疫肽组(Immunopeptidomics)是指从MHC(主要组织相容性复合体)分子上解析出的肽段组成的集合,揭示了细胞如何将内源性或外源性蛋白片段呈递给免疫系统。该领域正快速发展,成为癌症新抗原发现、T细胞免疫治疗设计和个体化疫苗研发的关键技术支撑。 然而,免疫肽组学的研究仍面临两大挑战: 1、

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人工智能在免疫肽组学中的应用:预测与识别新抗原

在癌症免疫治疗时代,新抗原(Neoantigen)的发现被认为是个体化癌症疫苗设计和T细胞免疫治疗的关键突破口。新抗原通常来源于肿瘤细胞中的非同义突变,其产物可以通过抗原加工通路被呈递至细胞表面的MHC分子,进而被T细胞识别。然而,新抗原的识别并不简单。由于每个患者的HLA背景、突变谱以及抗原加工机

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如何开展Shotgun蛋白组数据库搜索与FDR控制?

Shotgun蛋白组学实验中,质谱仪获取的仅是肽段碎片的m/z信号,这些数据本身无法直接告诉我们样本中有哪些蛋白质。真正实现蛋白鉴定的关键步骤是Shotgun蛋白组数据库搜索,即通过算法将质谱谱图与理论肽段进行比对,从而反推出原始蛋白组成。然而,数据库匹配并非“绝对正确”,由

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如何溶解疏水性膜蛋白而不影响其质谱分析?

疏水性膜蛋白在细胞生理过程中发挥着关键作用,广泛参与信号转导、物质运输和细胞识别。然而,这类蛋白质因其高度疏水的跨膜结构域,在质谱分析前的样本前处理阶段面临极大挑战。常规裂解缓冲液难以有效溶解这些膜蛋白,导致其提取效率低、易聚集沉淀,甚至干扰胰蛋白酶酶解和质谱离子化过程。要实现疏水性膜蛋白的高通量、

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如何优化膜蛋白样本前处理步骤以提高鉴定效率?

优化膜蛋白样本前处理步骤,是实现高效、高覆盖度蛋白质组学分析的关键之一。由于膜蛋白具有疏水性强、溶解难、丰度低、易降解等特点,其提取和消化过程远比可溶性蛋白复杂。因此,构建一套针对膜蛋白的高效前处理策略,不仅能显著提升质谱鉴定数量,还对药靶筛选、信号转导研究等方向具有重要意义。 一、膜蛋白的特殊性

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如何利用质谱技术进行高灵敏膜蛋白鉴定?

膜蛋白(Membrane proteins)约占细胞蛋白质组的30%,却承担了超过60%的药物靶点功能。无论是G蛋白偶联受体(GPCRs)、离子通道,还是受体酪氨酸激酶,它们几乎都归属于膜蛋白家族。然而,在蛋白组学研究中,膜蛋白却一直是最难“攻克”的堡垒之一。 这类蛋白往往:

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